طيمثاوس الثاني(2) خلف مار يهبألاها الثالث على كرسي بطريركية كنيسة المشرق مار طيمثاوس الثاني (1318 ـ 1332) كان مار طيمثاوس هذا مطراناً على أبرشية الموصل وكان أسمه يوسف، وعندما توفي مار ابراهيم مطران أربيل، نقل يوسف إلى هذه الابرشية في عام 1310 وذلك قبيل الأحداث المأساوية التي حدثت في قلعتها  حيث قتل العديد من المسيحيين. وقد يكون يوسف هذا هو المطران الذي بذل قصارى جهده لدى السلطات المغولية لتجنب هذه المجزرة الرهيبة، وللذود عن البطريرك مار يهبألاها الثالث، وعن المؤمنين القاطنين في تلك المنطقة. وإذا كانت تلك الجهود الجبارة لم تسفر عن نتيجة فإن الأساقفة لم ينسوا هذا الفضل الكبير. فما أن توفي البطريرك في نهاية عام 1317، حتى توجهت أنظار الناخبين إلى يوسف واتفقت الآراء على إقامته جاثليقاً على كنيسة المشرق وذلك بالنظر إلى نشاطه وشخصيته وإلى علمه الغزير ومعرفته للغات وحكمته في الإدارة. فسمي طيمثاوس، وهو الثاني بهذا الاسم بين جثالقة كنيسة المشرق.